Projekt zum 150-jährigen Bestehen der Stadt Yokohama. Auf dem Planeten Abel leben Menschen und Roboter zusammen. Eines Tages versucht ein mysteriöser Blinder Passagier an Bord eines Transportraumschiffs, den Planeten zu überfallen, doch Apollo (Hayato Ichihara), ein Roboter, der wie ein Mensch aussieht, und Mikaru (Aya Ueto), ein Mensch, der wie ein Roboter aussieht, entdecken ihn. Der Blinde Passagier besaß einen Speicherchip mit der neuesten Tarnsoftware, dem geheimnisvollen „Cipher“-Betriebssystem. Apollo nimmt den Cipher-Chip nur zum Spaß an sich, ahnt aber nicht, worauf er sich einlässt. Plötzlich verhält er sich seltsam, doch Mikaru hat keine Ahnung, was mit ihm los ist oder dass Cipher dahintersteckt. Was genau ist Cipher? Welche Geheimnisse birgt es? Apollo und Mikaru lüften ein Rätsel, das Vergangenheit, Gegenwart und Zukunft umspannt, um es herauszufinden.
