In einem Versuch, Informationen über Unsterblichkeit zu sammeln, haben Wissenschaftler aus aller Welt zusammengekommen, um „Himmelsgate“ – das Grab, das zur Labor des mythischen Königs Gilgamesh wurde – zu studieren. Doch bald darauf wird die Forschung als unethisch eingestuft und alle geplanten Arbeiten eingestellt. Eine Gruppe von Terroristen stürmt jedoch die Anlage ohne Rücksicht und verursacht eine Explosion, die zum Zusammenbruch einer fortschrittlichen Informationszivilisation führt. Viele Jahre nach dem Vorfall sind die Geschwister Tatsuya und Kiyoko Madoka auf der Flucht vor Schlägern. Doch dies scheint das geringste ihrer Sorgen zu sein, denn sie geraten mitten in einen Krieg zwischen zwei mächtigen, kryptischen Fraktionen. Beide Gruppen behaupten, für das Wohl der Gesellschaft zu kämpfen, und Tatsuya und Kiyoko müssen einen Weg finden, zu entscheiden, wem sie vertrauen können.
