Eines Tages ändert sich die so friedliche Stimmung an der Ourin Gakuen schlagartig. Kusunoki-sensei, die sogenannte Nebenheldin, übernimmt zusammen mit dem Großteil der Schülerinnen nach einem Staatsstreich die Schule. Der Direktor wird niedergeschlagen, und nun liegt es an Yuu Sakurano, Yuzuki Kaede und Nagomi Fujikura, die Schule zurückzuerobern und die früheren friedlichen Tage wiederherzustellen. Dies ist der Beginn eines umfassenden Krieges, wie ihn diese Schule noch nie erlebt hat.