In einer dunklen, späten Nacht in New York City wird Ryu von Attentätern verfolgt und angegriffen. Nachdem er sie ausgeschaltet hat, findet er einen Ausweis der Friedman Company. Am nächsten Tag wird bekannt gegeben, dass Dr. Ned Friedman ein Heilmittel gegen Krebs entdeckt hat. Doch nachdem er auf seiner Pressekonferenz keine Informationen preisgibt, beschließt die Reporterin Sarah, gemeinsam mit ihren Freunden Robert und Jeff Nachforschungen anzustellen. Als Ryu eines Tages an Dr. Friedmans Haus vorbeikommt, hört er die Stimme eines jungen Mädchens, das um Hilfe ruft. Als Sarah und ihre Begleiter das Haus ebenfalls untersuchen, treffen sie auf ihren Kollegen Ryu. Daraufhin entdecken sie, dass Dr. Friedman Experimente an lebenden Menschen mit Biotechnologie durchführt und dass dies möglicherweise mit der Macht der Evil Gods zusammenhängt, die Ryu in der Vergangenheit besiegt hat. Doch als Ryus Freundin Irene entführt wird, muss er erneut seine Rolle als Dragon Ninja annehmen, um diesen neuen Feind zu besiegen und sie zu retten.

