Tiefseearchäologe Hiroshi Ibuki gehört zu einem Grabungsteam, das am Meeresgrund nach den Ursprüngen der Erde sucht. Stattdessen stößt es auf eine rätselhafte Bakterienkolonie, die ein Leuchten verströmt, das dem Polarlicht ähnelt. Die uralten Bakterien erwachen und versuchen, die Welt für sich bewohnbar zu machen – ein Vorgang, der die Erde in ihren frühen Urzustand zurückversetzen und dabei alles gegenwärtige Leben auslöschen würde.