Der junge Jiro findet seine Mutter und seine Schwester ermordet in seinem Haus vor. Zu Unrecht des Verbrechens beschuldigt, flieht er aus seinem Dorf und begegnet einem Priester namens Tenkai, der ihn dazu bringt, einen abtrünnigen Ninja namens Tarouza zu töten. Nach Erfüllung dieser Aufgabe durchläuft Jiro eine Ausbildung zum Meisterassassinen. Viele Jahre später erfährt Jiro, dass er ein Waisenkind war und sein leiblicher Vater Tarouza, der für Tenkai gearbeitet hatte, bis er seine Mission abbrach, als er sich in eine Ainu-Frau verliebte. Der junge Ninja entdeckt, dass das Shogunat den verlorenen Schatz von Captain Kidd bergen und nutzen wollte, um Japan erneut vom Rest der Welt zu isolieren. Mithilfe der Hinweise, die Tarouza geheim gehalten hatte, reist Jiro – zusammen mit der weiblichen Ninja Oyuki und einem Sklaven namens Sam – nach Russland und Amerika, um den Schatz zu suchen, in der Hoffnung, ihn für Rache an Tenkai einzusetzen.
