Hayatos Stadt wird von einem riesigen Roboter verwüstet, seine Eltern kommen bei dem Massaker ums Leben. Als einziger Freund bleibt ihm sein Hund Jack, als einzige Dinge bleiben ihm der Schuh seiner Mutter und das Foto eines Mannes und einer Frau, die, wie sein Vater ihm auf dem Sterbebett verrät, seine leiblichen Eltern sind. Nun sinnt Hayato auf Rache an dem, der den Roboter angeblich geschickt hat: dem schrecklichen Geisterschiff, das Schiffe bedroht und angeblich alles auslöschen will. Doch dann stößt Hayato auf eine geheime unterirdische Fabrik von Herrn Kurosio, dem Besitzer von fast allem in der Stadt – und begreift, dass die Dinge nicht so sind, wie Herr Kurosio ihm erzählt hat... Jemand Schreckliches lebt in einem Schloss unter dem Meer... Hayato versucht, den Menschen die Wahrheit zu sagen – doch sein Leben ist nun in Gefahr durch den, der nicht erkannt werden will. Dann wird Hayato von niemand Geringerem als dem Kapitän des Geisterschiffs gerettet... Hayato steht kurz davor, mehr aufzudecken als das eine Geheimnis, nach dem er gesucht hat.
